作为学校唯一一个科研教学型二级学院，我院非常注重科学研究工作，形成了通过科研强教学，结合教学促科研的发展模式，取得了一批有分量的学术成果。先后承担国家哲学社会科学基金项目10余项，省部级科研项目20余项，发表学术论文200余篇，出版学术专著40余部，获得省部级以上奖励20余项。

2010年以来，全院教师共主持和参与各类科研项目70多项，项目总金额达600多万元，其中参与国家重大项目2项，主持国家级项目10多项；主持省部级项目20多项；主持校级项目40多项。

先后在《民族研究》、《中国藏学》、《西藏研究》、《西藏大学学报》、《西北民族研究》、《西南民族大学学报》、《中南民族大学学报》等学术期刊上发表论文200余篇（含核心期刊论文70余篇）。出版了《明实录藏族史料》、《清实录藏族史料》、《明清治藏史要》、《西藏民俗文化》、《中国少数民族·门巴族》、《门巴族、珞巴族简史》、《西藏通史·松石宝串》、《西藏密教史》、《西藏佛教诸派宗义》、《六世班禅巴丹益西传》、《觉囊派教法史》、《觉囊派教法史略》、《中论广释——正理海论》、《格鲁派教法史——黄琉璃宝鉴》、《藏传佛教研究》、《第吴宗教源流》、《藏汉佛教哲学比较研究》、《乾隆朝大小金川之役研究》、《白石释比与羌族》、《藏汉接合部多元宗教共存与对话研究——以舟曲地方为例》《四库全书馆发微》、《神圣与世俗--宗教文化与藏族社会》、《中国扶持人口较少民族发展的理论与政策实践研究》、《门巴族珞巴族非遗保护及旅游开发研究》等学术专著40余部；

获省部级科研成果奖20余项，其中《明实录藏族史料》、《清实录藏族史料》获国家教委优秀成果二等奖、《明清治藏史要》获教育部第三届中国高校人文社会科学研究优秀成果三等奖、《西藏地方与中央政府关系史》获全国“五个一”工程入选作品奖；索南才让研究员的译著《西藏通史》获第一届珠峰奖一等奖、《西藏密教史》获陕西省第六次哲学社会科学优秀成果一等奖；陈立明教授的《西藏民俗文化》获陕西省哲学社会科学优秀成果三等奖、《门巴族珞巴族经济社会发展现状调查》获全国民委系统调研报告评选优秀奖、《门巴族珞巴族的历史发展与当代社会变迁》获第二届国家民委民族问题研究优秀成果奖论文类三等奖、《西藏边疆跨境民族现状研究》获西藏自治区高等学校人文社会科学研究优秀成果二等奖；朱玉福教授的论文《中国扶持人口较少民族政策实践程度评价及思考》获国家民委社会科学研究成果二等奖、《村落终结与乡土重建——青藏铁路拉萨柳梧站失地农民安置与市场化转移研究》获全国民委系统调研报告三等奖、《西藏门巴、珞巴族全面建设小康社会探讨》获国家民委社会科学研究成果奖三等奖、《中国扶持人口较少民族政策落实情况调研》获国家民委社会科学研究成果三等奖、《改革开放30年来我国民族地区扶贫开发的成就、措施及经验》获西藏自治区高等学校人文社会科学研究优秀成果三等奖；周毓华教授的《简明藏族史教程》获西藏自治区优秀教学成果二等奖、《白石释比与羌族》获陕西省第十次哲学社会科学优秀成果奖三等奖、《西藏高校毕业生就业状况调查及对策研究报告》获国家民委优秀调研报告三等奖、《当雄县基层党组织建设状况调查与对策研究》获全国民委系统优秀调研报告奖；彭陟焱教授的《邛崃羌族安置区教育状况调查》获国家民委优秀调研报告三等奖、《乾隆朝大小金川之役研究》获第二届国家民委民族问题研究优秀成果奖著作类三等奖；马宁副教授的《西藏非物质文化遗产保护的现状与问题调研报告》获得国家民委系统优秀调研报告奖、《珞巴族人跨界贸易的现状与问题调查报告》获国家民委优秀调研报告二等奖、《藏汉结合部多元宗教共存与对话研究——以舟曲地方为例》获第三届民族问题研究优秀成果三等奖、《4·25地震后樟木夏尔巴受灾群众安置情况调查报告》获国家民委优秀调研报告一等奖。