历史学是西藏民族学院最早设立的本科专业之一，1980年正式开设历史学本科专业。本学科参照国内一些知名大学的教学计划，并结合西藏的实际情况，设立一些课程，主要有中国通史（古、中、近、现）、世界通史（古、中、近、现）、藏族史、藏传佛教史、西藏宗教概论等等。在最初阶段，本学科各门课程的师资配置注重梯队建设，经过多方面的努力，在最初的10年，形成了一支科研能力强、教学水平高、教学效果好的师资队伍。
2011年中国史获得了硕士学位一级学科授予权。目前本学科已在相关的二级学科专门史方面形成几个特色鲜明、成果显著的发展方向：在藏族文化史方面，已经形成以藏族史学史及传统史学理论研究、藏族文学史、民间风俗史等为核心的系列成果、在中国民族史方面，已经产生在西藏地方与中央政府关系史、藏族与喜马拉雅山地族群关系史、吐蕃史、明清藏族史为核心的系列成果，在思想史方面已经产生相关的藏传佛教史、藏传佛教文献学的系统研究成果。此外，在中外关系史（西藏涉外关系史）等方向也均有成果形成。
本学科目前拥有教师20人，年龄大都在45岁以下，包括6名教授，10名副教授，4名博士、6名硕士，年龄、职称和学历结构比较合理。
本学科在国内外享有一定的学术知名度。尤其是近年来推出了不少科研成果，承担了多项国家社科基金和有关部委的重点课题。一些项目如《明实录藏族史料》、《清实录藏族史料》获全国高校人文社科优秀科研成果二等奖；《西藏地方与中央政府关系史》获全国“五个一”工程入选作品奖；《明清治藏史要》获全国高校人文社科优秀科研成果三等奖；《西藏密教史》获陕西省哲学社会科学优秀成果一等奖。一些研究项目和专著如《西藏密教史》、《西藏民俗文化》、《藏族史学发展史纲要》等还填补了学术空白。迄今发表本研究方向的学术论文近180篇，其中近30篇成果被人大复印资料等报刊全文转载或论点摘编，取得了良好的学术影响。